Le microbiote humain est riche de quelque 10 000 espèces différentes de bactéries, virus, champignons… Les progrès réalisés grâce aux techniques de biologique moléculaire et au séquençage de nouvelle génération ont permis de mettre en évidence des interactions complexes du microbiote et de l’hôte, avec un rôle dans plusieurs fonctions essentielles comme la régulation de la réponse inflammatoire ou le développement du système immunitaire.