La connaissance de l’embryologie permet de comprendre les anomalies pouvant toucher le cordon ombilical en période néonatale. Le cordon est à l’origine formé de vaisseaux sanguins (deux artères et une veine à la naissance), du canal omphalo-mésentérique et de l’allantoïne (qui devient ensuite l’ouraque à l’origine de la vessie).

À la naissance, plusieurs types d’anomalies peuvent être observées : reliquats embryonnaires (d’origine digestive ou urinaire), fistules, hernie ombilicale.