La méthode standard de restauration de l'œsophage suite à une atrésie ou une résection partielle, consiste à rétablir la continuité œsophagienne en rapprochant les bords des parties encore intactes de l'œsophage, ou à remplacer les parties manquantes par un prélèvement d'autres parties du tissu digestif.

Depuis le début des années 2010, plusieurs équipes tentent de nouvelles approches moins invasives reposant sur la reconstruction de l'œsophage par voie endoscopique transluminale.