Presque constante après une amputation, la douleur fantôme est liée à la persistance de la représentation corticale au niveau du cortex somatosensoriel primaire (ou S1). Elle peut s’observer cliniquement lorsque la stimulation des zones corporelles adjacentes au membre amputé déclenche des sensations dans celui-ci. Les organes fantômes autres que les membres sont moins connus et leur fréquence est proportionnelle à leur représentation corticale et à l’histoire médicochirurgicale. Ainsi, la présence fantôme des seins est de 50 % (avec des douleurs dans 11 % des cas).