En 2003 était créé le DNDi « dans un contexte de panne de recherche et de développement pour les maladies négligées dans des pays aux faibles ressources », exprime le Dr Bernard Pécoul. Un élément important du modèle de fonctionnement est le partenariat privé-publique, avec les industriels, des ONG, des Académies et des donateurs, engagés dans la recherche et le développement de nouveaux médicaments en faveur de maladies tropicales oubliées. Au niveau français, on compte de nombreux acteurs, notamment l’Institut Pasteur, Sanofi, MSF, l’État (MAEE et AFD), l’UNITAID.