L'idée que la douleur chronique est souvent liée à une perte de modulation cérébrale motive l'intérêt thérapeutique pour la stimulation magnétique transcrânienne (TMS : Transcranial Magnetic Stimulation). Indolore et non invasive, la TMS permet de stimuler ou d'inhiber des zones du cerveau impliquées dans la douleur chronique.

En psychiatrie, la TMS s'est avérée aussi efficace que les électrochocs dans les dépressions sévères et ceci sans destruction neuronale.