Le microbiote est l'ensemble des micro-organismes vivant dans un environnement spécifique, tel que l’intestin, chez un hôte. Chez l'homme, le microbiote intestinal joue un rôle important lors de la digestion, mais aussi pour la régulation du système immunitaire. Chaque humain abriterait un total d’environ 40 000 milliards de bactéries (soit plus que le nombre de cellules du corps), dont 200 à 250 espèces différentes. Le microbiote intestinal doit donc être considéré comme un organe spécifique et l'homme symbiotique pourrait être surnommé "Homo microbicus" !