La dernière méthode couple l’identification moléculaire par PCR et celle par spectrométrie de masse : la PCR/ESI-MS. Ll’amplification de régions conservées du génome bactérien et de régions spécifiques d’espèces bactériennes conduit à des produits d’amplification qui sont ensuite identifiés par leur spectre en spectrométrie de masse.
Une étude multicentrique internationale a inclus des patients de huit réanimations dans six pays d’Europe, dont la France, présentant un sepsis et pour lesquels une prise de sang additionnelle était directement soumise à la PCR/ESI-MS, en comparaison rétrospective a posteriori avec le parcours d’identification microbiologique standard sur hémocultures (4).
Sur 204 échantillons provenant de 173 patients, 92 identifications de bactéries (par quelque méthode que ce soit) chez 61 patients ont été comparées. 22 étaient identifiées par les deux méthodes, 3 uniquement par culture et 67 uniquement par PCR/ESI-MS. L’analyse a posteriori par un panel d’experts a conclu à 41 % d’adaptations plus précoces de l’antibiothérapie (modifications, arrêt, démarrage) sur les résultats rapides de la PCR/ESI-MS fournis dans les 8 heures. La valeur prédictive négative (VPN) élevée (97 %) de la PCR/ESI-MS pourrait surtout servir à écarter le diagnostic d’infection.
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